Basée à Dallas, Colossal Biosciences, l’entreprise autoproclamée de désextinction derrière le laineux mammouth et thylacine, est issue de Form Bio, une nouvelle société de logiciels indépendante offrant une plate-forme informatique en sciences de la vie qui comble le fossé entre les données et la découverte.
Gérée par des algorithmes d’intelligence artificielle (IA) d’apprentissage en profondeur, Form Bio offre aux scientifiques de la vie une plate-forme logicielle complète pour gérer de grands ensembles de données, exécuter des flux de travail vérifiés, visualiser les résultats et collaborer avec leurs pairs. La plate-forme rassemble ces capacités dans une unité cohérente avec une expérience utilisateur intuitive conçue pour simplifier le travail informatique et renforcer les percées en sciences de la vie dans les entreprises, les laboratoires et les universités.
Il est conçu pour être appliqué à un large éventail de cas d’utilisation, notamment la découverte de médicaments, la thérapie génique et cellulaire, l’efficacité de la fabrication, la recherche universitaire, etc. Form Bio entre sur le marché avec un cycle de financement de série A de 30 millions de dollars dirigé par JAZZ Venture Partners avec la participation de Thomas Tull, investisseur principal de Colossal.
« Form Bio est la pièce manquante de la découverte scientifique », a déclaré Ben Lamm, cofondateur et PDG de Colossal. «Lorsque vous avez une grande entreprise scientifique comme l’extinction d’une espèce, vous avez non seulement besoin des scientifiques les plus intelligents du monde, vous avez besoin de logiciels puissants, dont la plupart n’existaient tout simplement pas jusqu’à présent. Après avoir passé en revue tout ce qui existe sur le marché, nous avons choisi de créer notre propre solution logicielle. Maintenant, nous voulons partager cette plate-forme moderne et complète avec la communauté au sens large pour avoir un impact sur d’autres domaines de l’innovation scientifique, y compris la santé humaine. »
Form Bio a été créée presque en parallèle avec Colossal, la société qui est devenue célèbre pour avoir appliqué la technologie CRISPR à des fins de restauration d’espèces, de protection d’espèces en danger critique d’extinction et de repeuplement d’écosystèmes critiques qui soutiennent la poursuite de la vie sur Terre. À l’époque, l’équipe Colossal a reconnu le manque de capacités logicielles nécessaires sur le marché et les insuffisances des processus bioinformatiques traditionnels pour analyser rapidement d’énormes volumes de données. Plus important encore, ils ont remarqué que le marché ne disposait pas des outils nécessaires à l’équipe de Colossal elle-même pour la génomique comparative et la biologie computationnelle.
Développé initialement pour faire avancer la désextinction, Form Bio était une solution qui avait le potentiel de faire face au déluge de données tout en répondant au besoin urgent de l’industrie d’une plate-forme simple et conviviale pour remplacer les montagnes de code et les processus de traitement des données encombrants et des outils sous-développés.
L’équipe de biologistes informatiques de Colossal, ainsi que l’équipe de scientifiques du Church Lab et plus de 35 généticiens des laboratoires de Colossal à Boston et à Dallas, ont travaillé pour développer et affiner les capacités de la plate-forme de base de Form Bio pour le marché plus large.
L’avenir de la bio-ingénierie : IA et apprentissage automatique
« La conception, la fabrication, les analyses de test et l’apprentissage automatique assistés par ordinateur sont essentiels pour l’avenir de la bio-ingénierie en général et en particulier pour la restauration de la diversité génétique en voie de disparition et éteinte pour les espèces clés dans les écosystèmes vitaux », a déclaré le cofondateur de Colossal, George Church, professeur à Harvard Medical School et MIT, et directeur de la biologie synthétique au Wyss Institute de Boston. « Form Bio est le logiciel essentiel pour ouvrir la voie. En tant qu’ingénieurs scientifiques, nous avons besoin de ces pipelines et attendons avec impatience des percées plus rapides dans les découvertes et les applications scientifiques, maintenant que les logiciels ont rattrapé la science. »
La plate-forme Form se situe à l’intersection de la biologie et de la découverte. Il rassemble les composants de base de la gestion des données, des flux de travail, de la visualisation des résultats et de la collaboration dans une solution cohérente. Form comprend un vaste catalogue de flux de travail vérifiés, couvrant un large éventail de cas d’utilisation scientifique, de l’analyse de l’ADN ancien et de la transcriptomique à la thérapie génique AAV.
La plate-forme sert également de base pour des applications avancées basées sur l’IA et adaptées aux besoins d’industries et de domaines universitaires spécifiques. « Les scientifiques aiment bricoler et faire des choses très sur mesure. La plateforme leur permet de télécharger leurs propres workflows ou d’utiliser les workflows que nous avons déjà développés et validés. Cela leur donne donc l’assurance que c’est quelque chose dont ils peuvent se fier à la sortie et que s’ils apportent un ensemble de données différent en six mois pour obtenir des résultats comparables », a déclaré Claire Aldridge, Ph.D., directrice de la stratégie chez Form Bio.
Avec le lancement de Form Bio, Kent Wakeford passera de son rôle quotidien de COO de Colossal à celui de co-PDG de Form Bio, où il travaillera aux côtés du co-PDG Andrew Busey et soutiendra le PDG et le conseil d’administration de Colossal. dans un rôle de conseiller spécial exécutif. L’ancien directeur de l’exploitation de Biolabs, Adam Milne, a également rejoint Colossal en tant que nouveau directeur de l’exploitation.
« Nous avons créé une plate-forme intégrée qui est en développement depuis 18 mois. Il permet aux utilisateurs de prendre une idée et de la mettre en production d’une manière plus efficace et rentable. En adoptant une approche plus ouverte et transparente, la plate-forme peut utiliser différents ensembles d’outils, exporter des données de la manière qu’elle choisit, effectuer une analyse informatique avec nos modèles d’apprentissage automatique et d’IA, et partager les informations avec des pairs ou d’autres revues. En un mot, nous aspirons à être comme le GitHub pour la science », a déclaré Wakeford à VentureBeat.
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