La sous-variante omicron appelée BA.5 a été initialement repérée en Afrique du Sud en février 2022 et s’est rapidement répandue dans le monde entier. À la 2e semaine de juillet 2022, BA.5 représentait près de 80 % des versions de COVID-19 aux États-Unis.
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Peu de temps après que des chercheurs d’Afrique du Sud ont rapporté la version originale de la variation d’omicron (B. 1.1.529) le 24 novembre 2021, de nombreux chercheurs, dont moi, ont émis l’hypothèse que si les nombreuses anomalies d’omicron en faisaient soit plus transmissible, soit bien meilleur pour l’évasion immunitaire que la version delta précédente, omicron pourrait devenir l’alternative dominante dans le monde.
La variante omicron a en effet fini par être dominante au début de 2022, et plusieurs sous-lignées, ou sous-variantes, d’omicron ont depuis émergé : BA.1, BA.2, BA.4 et licence.5, pour n’en nommer que quelques-unes. Avec l’apparition continue de ces versions extrêmement transmissibles, il semble que le SRAS-CoV-2, le virus qui déclenche le COVID-19, utilise avec succès des techniques intemporelles que les infections utilisent pour échapper au système immunitaire. Ces techniques d’évasion varient de la modification de la forme des protéines clés reconnues par les anticorps protecteurs de votre système immunitaire au camouflage de son produit héréditaire pour inciter les cellules humaines à le considérer comme une partie d’elles-mêmes plutôt qu’un envahisseur à attaquer.
I suis un virologue qui étudie les infections émergentes et les virus qui sont passés des animaux aux humains, comme le SRAS-CoV-2. Mon groupe d’étude de recherche a suivi la transmission et l’avancement du SRAS-CoV-2, évaluant les changements dans la façon dont les sous-variants de l’omicron échappent au système immunitaire du corps et la gravité de la maladie qu’ils provoquent après l’infection.
Le baccalauréat degré.5 est beaucoup mieux capable d’échapper au système immunitaire de l’organisme que les sous-variantes précédentes.
Comment mesure-t-on la transmissibilité des infections dans une population ?
Le nombre de reproduction de base, R0 – prononcé « R-naught »– détermine la transmissibilité d’une infection dans une population encore non infectée.
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As Une fois qu’une proportion d’individus dans une population finit par être immunisée en raison d’une infection ou d’une vaccination antérieure, les épidémiologistes utilisent le terme numéro de récréation efficace, appelé Re ou Rt, pour déterminer la transmissibilité du virus. Le Re de la version omicron a été estimé à 2,5 fois supérieur à celui de la version delta. Cette transmissibilité accrue a probablement aidé l’omicron à surpasser le delta pour finir par être la variante dominante.
La question plus large est donc de savoir ce qui motive l’évolution des sous-lignées d’omicron ? La réponse à cela est une procédure populaire appelée sélection naturelle. Le choix naturel est une procédure évolutive où les traits qui confèrent à une espèce un avantage reproductif continuent d’être transmis à la génération suivante, tandis que les traits qui ne le sont pas sont progressivement éliminés par les concurrents. Alors que le SRAS-CoV-2 continue de circuler, le choix naturel préférera les anomalies qui offrent au virus le plus grand avantage de survie.
Qu’est-ce qui rend omicron et ses ramifications si sournois à se propager ?
De nombreux ajoutent à la transmissibilité accrue des variations du SARS-CoV-2. L’un est la capacité de se lier plus fortement au récepteur ACE2, une protéine dans le corps qui aide principalement à contrôler la pression artérielle, mais peut également aider le SRAS-CoV-2 à pénétrer dans les cellules. Les sous-lignées omicron les plus courantes présentent des anomalies qui les rendent bien meilleures pour s’éloigner de la défense des anticorps tout en conservant leur capacité à se lier avec succès aux récepteurs ACE2. La sous-lignée BA.5 peut échapper aux anticorps de la vaccination et de l’infection antérieure.
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Diplôme de licence des sous-lignées Omicron.4 et licence.5 partagent de nombreuses mutations avec les sous-lignées omicron antérieures, mais ont également trois mutations spéciales : L452R, F486V et la réversion (ou l’absence de mutation) de R493Q. L452R et F486V dans la protéine de pointe aident les anticorps d’échappement BA.5. De plus, la mutation L452R aide le virus à se lier plus efficacement à la membrane de sa cellule hôte, une fonction vitale liée à l’intensité de la maladie COVID-19.
La sous-variante bachelor.5 est responsable des deux tiers de tous les cas de COVID-19 existants aux États-Unis.
Bien que l’autre mutation de BA.5, F486V, puisse aider la sous-lignée à s’échapper de types spécifiques d’anticorps, elle pourrait diminuer sa capacité à se lier à l’ACE2 . De manière notable, BA.5 semble compenser la diminution de la force de liaison de l’ACE2 par une autre mutation, la réversion R493Q, censée restaurer son affinité perdue pour l’ACE2. La capacité d’échapper efficacement à l’immunité tout en préservant sa capacité à se lier à l’ACE2 peut avoir contribué à la propagation mondiale rapide du baccalauréat.5.
En plus de ces anomalies d’évasion immunitaire, le SRAS-CoV-2 a évolué pour supprimer l’immunité naturelle de ses hôtes – dans ce cas, les êtres humains. La résistance naturelle est la première ligne de défense du corps contre les agents pathogènes, composée de protéines antivirales qui aident à combattre les virus. Le SRAS-CoV-2 a la capacité de supprimer l’activation de certaines de ces protéines antivirales clés, ce qui signifie qu’il est capable de franchir avec succès de nombreuses défenses de l’organisme. Ceci explique la propagation des infections chez les individus immunisés ou préalablement contaminés.
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L’immunité inhérente exerce une forte pression sélective sur SRAS-CoV-2. Delta et omicron, les deux versions les plus récentes et extrêmement efficaces du SRAS-CoV-2, partagent un certain nombre d’anomalies qui pourraient être de nature à aider l’infection à briser l’immunité naturelle. Les chercheurs n’appréhendent pas encore totalement les évolutions du Bachelor.5 qui pourraient lui permettre de le faire.
Et la suite ?
Le BA.5 ne sera pas la fin du jeu. Alors que l’infection continue de circuler, cette tendance évolutive entraînera probablement le développement de variantes plus transmissibles qui peuvent échapper au système immunitaire.
Bien qu’il soit difficile d’anticiper les prochaines versions, nous, les scientifiques, ne pouvons pas écarter le possibilité que certaines de ces versions puissent entraîner une intensité accrue de la maladie et des taux d’hospitalisation plus élevés. À mesure que le virus continue de progresser, la plupart des gens contracteront le COVID-19 plusieurs fois, quel que soit leur statut vaccinal. Cela pourrait être compliqué et aggravant pour certains, et peut ajouter à la réticence à la vaccination. Par conséquent, il est important de reconnaître que les vaccins vous protègent contre les maladies graves et la mort, pas toujours contre l’infection.
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L’étude de recherche au cours des 2 ans et demi précédents a aidé des scientifiques comme moi à découvrir beaucoup de choses sur cette nouvelle infection. Néanmoins, de nombreuses préoccupations sans réponse restent dues au fait que le virus progresse constamment, et nous essayons de cibler un poteau de but en mouvement continu. Bien que la mise à jour des vaccins pour correspondre aux variations fluides soit une option, cela peut ne pas être pratique à court terme car le virus progresse trop rapidement. Les vaccins qui créent des anticorps contre une large série de variantes du SRAS-CoV-2 et un cocktail de traitements à large spectre, composé d’anticorps monoclonaux et de médicaments antiviraux, seront importants dans la bataille contre le COVID-19.
Suresh V. Kuchipudi, professeur et président des maladies transmissibles émergentes, État de Penn
Cet article est republié de The Discussion sous une licence Innovative Commons. Consultez le court article initial.
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